Die Pestizidrichtlinie wurde bereits im Vorhinein in der Landwirtschaft heftig kritisiert. Um auf chemische Pflanzenschutzmittel verzichten zu können, müssten auch entsprechende Alternativen kurzfristig verfügbar sein, so die Bedenken. Nach wie vor werden Pestizide in den EU-Mitgliedstaaten in großem Maße eingesetzt. Die Befürchtung vieler Landwirte: Die Erträge könnten mit weniger Pestiziden sinken.